A Multidisciplinary approach to DNA Nano/Bio-Physics

Abstract

El ADN es una molécula altamente dinámica donde los pares de bases, que contienen información genética, pueden sufrir grandes fluctuaciones. La estructura del ADN ha sido ampliamente estudiada y conocida. Sin embargo, la comprensión de su dinámica, que influye de manera determinante en los procesos biológicos, es limitada.

La tesis está dedicada al estudio de estas dinámicas durante la desnaturalización térmica del ADN, que consiste en la separación completa de las cadenas que forman la doble hélice del ADN. Hemos explorado el melting del ADN con diferentes técnicas, experimentales y teóricas y lo hemos estudiado en muestras ordenadas, como fibras de ADN.

Se ha propuesto: un modelo teórico para el estudio de la dinámica; Caracterización física la transición de desnaturalización del ADN; Un método de síntesis para el diseño de fragmentos de ADN con secuencia controlada, para estudiar su flexibilidad, y caracterización de las fibras de A-DNA mediante microscopía AFM-RAMAN.

DNA is a highly dynamic molecule where base pairs, which contain genetic information, can suffer large fluctuations. The structure of DNA has been widely studied and it is well-known. However, the understanding of its dynamics, which has a decisive influence on biological processes, is limited.

The thesis is dedicated to the study of these dynamics during the thermal denaturation of DNA, which consists on the complete separation of the strands that form the double helix of DNA. We have explored the melting of DNA with different experimental and theoretical techniques and although is has been widely studied in solution, we have studied it in ordered samples, such as DNA fibers.

It has been proposed: a theoretical model for the study of dynamics; Physical characterization of DNA denaturing transition; A synthesis method for the design of DNA fragments with controlled sequence, to study their flexibility, and characterization of A-DNA fibers by AFM-RAMAN microscopy.